| Disciplines | Biologie |
|---|---|
| Domaines | Expression génique, systèmes, transcriptomique, modelisation biophysique, bacterie, chromatine, pathogénicité |
| Supporting organisms | INSA de Lyon, CNRS, UCBL |
| Geographical location | Domaine scientifique de la Doua - UCBL (LyonTech - la Doua) |
| Laboratoire d'appartenance | MAP (Microbiologie, Adaptation et Pathogénies) |
| Chef d'équipe | William Nasser/Sylvie Reverchon |
| Page web | http://map.univ-lyon1.fr/spip.php?article216&lang=fr |
Les données récentes suggèrent que la dynamique structurale de l’ADN est un des éléments permettant l’ajustement des programmes génétiques. Au premier rang des régulateurs transcriptionnels globaux bactériens, on retrouve les protéines associées au nucléoïde (NAPs), qui influencent à la fois la structure de la chromatine et l’initiation de la transcription. Les facteurs de transcription ayant des actions plus ciblées agissent donc sous les contraintes imposées par les NAPs.
Les différentes étapes du processus infectieux représentent une succession de conditions environnementales auxquelles la bactérie doit faire face. La plupart de ces conditions affectent la topologie de l’ADN. Ainsi les variations de la super-hélicité de l’ADN en réponse aux conditions hostiles pourraient être un signal permettant de déclencher l’expression des gènes de virulence et d’adapter le métabolisme bactérien aux conditions de l’hôte. Cependant, les liens existant entre les variations topologiques de la chromatine et les ajustements génétiques durant la transition du mode de vie saprophyte vers l’infection restent encore mal connus.
L’objectif essentiel de nos travaux est d’étudier l’impact de la topologie de l’ADN sur la modulation de l’expression du génome de la bactérie phytopathogène Dickeya dadantii. Il s’agit de comprendre comment les variations des conditions environnementales et physiologiques agissent, via les modulations de la super-hélicité de l’ADN, la dynamique des complexes nucléoprotéïques et des réseaux de régulation, sur la modulation de l’expression des gènes bactériens, notamment ceux impliqués dans le pouvoir pathogène et dans les processus adaptatifs.
