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Génétique des Variations Intra-Espèce

Disciplines Biologie
Domaines Génomique, Bioinformatique
Tutelles ENS de Lyon, UCBL, CNRS
Localisation géographique ENS de Lyon (Campus Charles Mérieux)
Laboratoire d'appartenance LBMC
Chef d'équipe Gaël Yvert
Page web http://www.ens-lyon.fr/LBMC/gisv/index.php/fr/
GISVNotre équipe étudie les mécanismes génétiques fondamentaux responsables des différences observables entre individus de la même espèce. L'enjeu est de mieux comprendre pourquoi certains individus sont plus disposés que d'autres à développer certains phénotypes. Cette question est au coeur de la médecine du XXIè siècle, qui pourra bientôt être personnalisée: l'information de l'ADN du patient permettra de prédire l'efficacité de tel ou tel traitement. Pour la plupart des caractères cliniques communs, une prise en charge personnalisée n'est pas encore possible, car la manière dont contribuent la séquence ADN est complexe. Par exemple, certains porteurs de mutations prédisposant au cancer ne développeront pas nécessairement la maladie.

Grâce d'une part à l'utilisation de modèles expérimentaux extrêmement puissants comme la levure S. cerevisiae et d'autre part aux outils génomiques et bioinformatiques, il est possible d'aborder des questions fondamentales relatives à la complexité par laquelle les génotypes contrôlent les variations phénotypiques. Notre ambition est de produire de nouvelles connaissances fondamentales, d'apporter des éléments de réponse à la prédisposition génétique aux maladies, et de transférer les méthodes de génétique quantitative dans la communauté biologiste.

La part génétique de la variation quantitative des caractères physiologiques (comme la taille des individus, le taux de cholesterol et la manifestation d'une maladie chez l'humain, ou bien les propriétés agronomiques et nutritives des cultures) est généralement très complexe. De nombreux gènes sont impliqués, qui contribuent de manière non-additive. Et leur effet n'est souvent pertinent que dans certaines conditions environnementales. En conduisant des recherches expérimentales sur un organisme unicellulaire très puissant, la levure du boulanger S. cerevisiae, nous cherchons à délimiter l'étendue de cette complexité et nous en décrivons certaines propriétés.

•    Génétique sur cellules uniques : En générant et analysant de nombreux caractères sur des cellules uniques, nous abordons les effets probabilistes que les gènes peuvent avoir sur les régulations moléculaires et cellulaires.

•    Epigénétique quantitative : L'ADN n'est pas le seul support d'informations héritables portées par la chromatine. C'est pourquoi nous étudions la variabilité naturelle épigénétique portée par les nucléosomes et comment cette variabilité influence les différences phénotypiques entre individus.