| Disciplines | Physics, Biology |
|---|---|
| Research fields | Polymer Physics, Chromatin, Statistical physics, Multi-scale models, DNA replication, Genomics, epigenetics, Dynamic systems, Signal processing, Bioinformatics |
| Supporting organisms | CNRS, ENS de Lyon |
| Geographical location | ENS de Lyon (Campus Charles Mérieux) |
| Lab | Laboratoire de physique |
| Team leaders | Benjamin Audit, Ralf Everaers, Cédric Vaillant |
| Webpage | http://www.ens-lyon.fr/PHYSIQUE |
Notre équipe de physiciens s’intéresse à l’organisation tant fonctionnelle (réplication, transcription) que spatiale (structure et dynamique) du génome. L’équipe est spécialisée dans l’analyse statistique des données génomiques et la modélisation des processus nucléaires. Nos domaines d’application actuels concernent principalement le programme de réplication de l’ADN des eucaryotes et l’écriture génomique du positionnement des nucléosomes. Il s’agit, d’une part, d’analyser des profils expérimentaux de réplication de l’ADN (timing de réplication, orientation des fourches de réplication) et de modéliser l’effet de la structure de la chromatine sur le programme de réplication. Nous pensons en particulier que l’analyse pangénomique quantitative et la modélisation mathématique de la réplication de l’ADN doivent nous permettre de mieux comprendre le stress réplicatif au cours de la progression tumorale. D’autre part nous étudions quelle est l’influence, sur l’évolution (profils de mutation, insertion des éléments transposables) des génomes de vertébrés, du positionnement des nucléosomes par la séquence nucléotidique.
