Skip to content. | Skip to navigation

Personal tools
Log in
Sections
You are here: Home Jobs Ingénieur(e) / Bioinformaticien(ne) en analyse de données biologiques à Grenoble

Ingénieur(e) / Bioinformaticien(ne) en analyse de données biologiques à Grenoble

Durée du poste : CDD (10 mois) 
Contrat renouvelable en fonction des financements disponibles 
Date de prise de fonction : 01/03/2019 

Localisation : 
Laboratoire TIMC-IMAG - équipe BCM 
Grenoble, France 
Contact : magali.richard@univ-grenoble-alpes.fr 

Contexte scientifique : 
Il existe une grande hétérogénéité tumorale entre les patients atteints de cancer. Cette variabilité diminue considérablement l’efficacité des traitements thérapeutiques. Malheureusement, quantifier et analyser cette hétérogénéité est très difficile. En partenariat avec le programme européen Innovative Education de l’EIT Health et le Plan Cancer de l’INSERM, nous proposons un projet d’exploration de l’hétérogénéité tumorale à partir de l’étude de la méthylation de l’ADN. 

L’ingénieur(e) recruté(e) sera en charge de : 
(i) développer un pipeline informatique pour collecter et traiter des données publiques de méthylation haut débit (450K, 800K, RRBS, WGBS). 
(ii) réaliser le traitement bioinformatique de données expérimentales (RNA-seq, methylation 800K et RRBS) produites par l’équipe (mélange expérimental de différents types de cellulaire, biopsies de tumeurs solides). 
(ii) créer un jeu de données permettant le benchmarking de méthodes de déconvolution de signal. Ce jeu de données sera ensuite utilisé dans un projet de data challenge. Cette tâche sera réalisée en collaboration avec nos partenaires de l'EIT Health, S. Escalera (Université de Barcelone) et I. Guyon (INRIA Paris). 

Profil et compétences recherchées : 
Formation (niveau Master, école d’ingénieur, ou équivalent) en bioinformatique 
Compétences avancées en programmation scientifique (R ou équivalent). 
Aptitudes à gérer et utiliser des données massives de type ‘omique’. 
Fort intérêt pour les applications biologiques ou médicales. 
Capacité à travailler en équipe dans un contexte interdisciplinaire. 
Maîtrise courante de l’anglais. 

Envoyer un CV, une lettre de motivation et 2 lettres de recommandation par courriel à magali.richard@univ-grenoble-alpes.fr